ארכיון פליישר – האוסף המקיף ביותר של עבודות המלחינה – נתרם לספריה הלאומית על ידי ציפי פליישר בשנת 2008 ומספרו במחלקת המוזיקה 0121 MUS.
הארכיון כולל עדויות רבות על תהליכי היצירה של המלחינה וכן כתבי יד, בתווים ובמילים, של עשרות יצירות אותן הלחינה בארבעים שנות יצירה. כמו כן מצויים בארכיון תמונות, מכתבים, מסמכים וגזרי עיתונים ובהם ביקורות, כתבות וראיונות עם ציפי פליישר ועל אודותיה. בנוסף, מצויות הקלטות של יצירותיה בארכיון הצליל.
ארכיון מקיף אודות הזמר העברי, שאותו ליקטה ואספה פליישר במשך עשרות שנים, מצוי אף הוא בשלבי העברה לארכיון מחלקת המוזיקה והוא יהיה המשך ופיתוח של ארכיון מאיר נוי לזמר העברי. הארכיון כולל מסמכים, מכתבים וגזרי עיתונים ומאות שעות של ראיונות עם אמנים מיוצרי הזמר העברי – דניאל סמבורסקי, נחמה הנדל, מתתיהו שלם, נעמי פולני ועוד.
