לספרייה הלאומית אוסף עשיר של מאגרי מידע אקדמיים וכתבי עת אלקטרוניים. עד היום הגישה לכלים אלו הייתה רק מתוך בניין הספרייה. אנו משקיעים מאמצים רבים במטרה לאפשר גישה גם מרחוק. הדבר תלוי בהסכמים מורכבים ובמגבלות הנוגעות לזכויות יוצרים.
המאגר הראשון שהצלחנו להנגיש, באופן חלקי, למשתמשים מחוץ לספרייה הוא מאגר JSTOR.
במסגרת פרויקט משותף של הספרייה הלאומית, ספריית אוניברסיטת חיפה ומאגר JSTOR נסרקו עשרות כתבי עת ישראליים, מהמובילים במחקר האקדמי. במסגרת ההסכם הספרייה הלאומית תאפשר גישה לכתבי עת אלקטרוניים אלו לכל אזרחי המדינה גם מהבית.