באוספי המחלקה נכללים ארכיונים אישיים שלמים של מלחינים בולטים, וכן ארכיונים של מוסדות מוסיקה בישראל. בין ארכיוניהם האישיים של המלחינים הארץ-ישראלים והישראלים נציין את ארכיונם של סשה ארגוב, פאול בן חיים, אנדרה היידו, משה וילנסקי, דב זלצר, עמנואל זמיר, מרדכי זעירא, מרק לברי, דניאל סמבורסקי, מרדכי סתר, יאיר רוזנבלום, נעמי שמר ונועם שריף.
החומר המצוי בארכיונים כולל – מלבד מוסיקה כתובה ומוקלטת בטיוטות ובנוסחים סופיים – גם פריטים נוספים רבים הקשורים לתהליך הכתיבה והביצוע, כגון תכתובת עם עמיתים ועם מבצעים, הקלטות קונצרטים, מודעות ותוכניות, ביקורות וצילומים.